由于神经系统对放射线的反应，早期即可出现胃肠道的症状。一般多出现在放疗开始后1～2周内。恶心、呕吐、腹泻、排出粘液或血样便。累及直肠者伴有里急后重。持久便血可引起缺铁性贫血。便秘少见。偶有低热。腹痛型肠易激综合症则提示小肠受累，乙状结肠镜检查可见粘膜水肿、充血，严重者可有糜烂或溃疡。

急性期的症状迁延不愈或直至放疗结束6个月至数年后始有显着症状者，均提示病变延续，终将发展引起纤维化或狭窄。此期内的症状，早的可在放疗后半年，晚的可在10年后甚至30年后才发生，多与肠壁血管炎以及扣续病变有关。

患者感觉直肠部不适，有时便秘、腹泻交替，随病情进展症状多以腹泻为主，粪便呈稀水样，混有脓血、味臭、里急后重、下腹痛、腹胀、食欲不振、消瘦。

便秘与腹泻交替，便中含有粘液及血丝，大便时肛门口灼痛。因分泌物刺激，肛门周围表皮脱落，有时成裂口发痒，下腹部胀满不适，食欲不振，体重减轻，全身不适。

溃疡性直肠炎一般在临床上表现为直肠功能紊乱。如果病变轻，可只有间歇性的直肠小量出血，常被误认为痔疮出血。有些患者表现为便秘，是炎症的直肠痉挛所致。左下腹痛、便秘和排小量血便是溃疡性直肠炎的典型表现。