本病发病与遗传因素有密切关系，强直性脊柱炎的HLA-B27阳性率高达90%～96%，家族遗传阳性率达23.7%，类风湿者其家族的发病率为正常人的2～10倍，而强直性脊柱炎家族的发病率为正常人的30倍。

泌尿生殖系感染是引起本病的重要因素之一，盆腔感染经淋巴途径播散到骶髂关节再到脊柱，还可扩散到大循环而产生全身症状及周围关节、肌腱和眼色素膜的病变。

有人发现60%AS病人血清补体增高，大部分病例有IgA型类湿因子，血清C4和IgA水平显着增高，血清中有循环免疫复合物(CIC)，但抗原性质未确定。以上现象提示免疫机制参与本病的发病。

创伤、内分泌、代谢障碍和变态反应等亦被疑为发病因素。总之，目前本病病因未明，尚无一种学说能完满解释AS的全部表现，很可能在遗传因素的基础上的受环境因素( 包括感染)等多方面的影响而致病。